https://biolabmix.ru/catalog/rna-transcription-mrna/?erid=LdtCKWnpq
Подписаться
Оглавление
Биомолекула

Хроника распространения SARS-CoV-2

Хроника распространения SARS-CoV-2

  • 8713
  • 6,3
  • 2
  • 5
Добавить в избранное print
Новость

«Биомолекула» пристально следит за ситуацией с коронавирусной пандемией и делится с читателями свежими новостями.

31 декабря 2019 года

ВОЗ была проинформирована о случаях пневмонии неизвестной причины в китайском Ухане.

1 января 2020 года

Рынок в Ухане был закрыт.

7 января

Китайские власти заявили, что смогли идентифицировать новый вирус и дали ему временное название — 2019-nCoV.

21 января

Уже сообщалось о 314 подтвержденных случаях заболевания, 309 из которых зафиксированы в Китае, остальные в Таиланде, Японии и Республике Корея, куда вирус был привезен из Китая.

22 января

О первом случае заражения в США объявила Нэнси Мессонньер, директор Национального центра иммунизации и респираторных заболеваний Центров по контролю и профилактике заболеваний (Centres for Disease Control and Prevention, CDC). CDC уже разработали скрининговый тест на вирус, чтобы отслеживать прибывающих в аэропорты США.

24 января

По последним данным ВОЗ, подтверждено 846 случаев заражения. 830 из них приходятся на Китай, причем зафиксировано 25 смертельных случаев и 177 человек находятся в тяжелом состоянии. Помимо материковой части Китая и специальных административных районов (Макао и Гонконг), заболевшие пациенты идентифицированы в Японии, Республике Корея, Тайване, Вьетнаме, Тайланде, Сингапуре и США (The Guardian сообщает о втором случае заражения в США) [1].

25 января

Объявили и о первых случаях заражения в Европе (все три во Франции) и Австралии. В Китае вирус уже поразил более 1200 человек и привел к 41 смертельному исходу.

26 января

Согласно последнему отчету ВОЗ, суммарно зарегистрировано 2014 случаев заражения, из которых 1985 приходятся на Китай (включая Тайвань, поскольку ВОЗ официально не признает суверенитет Китайской республики, но это уже отдельная тема для разговора). Кроме того, пораженные 2019-nCoV идентифицированы еще в 10 странах: Японии (3 пациента), Республике Корея (2), Вьетнаме (2), Сингапуре (4), Австралии (4), Малайзии (3), Таиланде (5), Непале (1), Франции (3), США (2, но CDC уже объявили о 5-и случаях). Вирус привел к 56 смертям.

Распространение SARS-CoV-2 на 26 января 2020 года

Рисунок 1. Распространение SARS-CoV-2 на 26 января 2020 года

28 января

В Китае уже 4537 заболевших, 976 из них в тяжелом состоянии, 106 человек умерли. За пределами Китая вирус распространился по 14 странам: к десяти названным выше добавились Камбоджа (1 человек), Шри-Ланка (1), Канада (2) и Германия (1). Всего — 56 заболевших. ВОЗ решила направить в Китай группу международных экспертов. Выяснилось, что рынок Хуанань не был единственным источником вируса. CEPI (Coalition for Epidemic Preparedness Innovations, норвежская Коалиция за инновации в обеспечении готовности к эпидемиям) объявила о готовности выделить 12,5 млн долларов разработчикам вакцины от нового вируса.

29 января

Группа ученых из Гонконгского университета под руководством проф. Юэна Квок-юнга (Yuen Kwok-yung) объявила, что уже изготовила вакцину против коронавируса (хотя подтверждений из авторитетных источников пока нет). Тестирование и клинические испытания, по словам Юэна, займут больше года.

31 января

Всего в мире уже 9776 инфицированных. Из них 213 умерших и 187 выздоровевших. Заболевшие появились в Объединенных Арабских Эмиратах (4 человека), Италии (2), Финляндии (1), Индии (1) и на Филлипинах (1). Ученые из Университета Джонса Хопкинса создали интерактивную обновляемую карту распространения заболевания.

1 февраля

Заболевших 14 573 человека. Умерли — 305, выздоровели — 340. Первые инфицированные появились в России и Великобритании. Но! Для сравнения: только в США, по данным CDC, в месяц в среднем заболевает гриппом 5 млн человек, и 5000 из них умирает! Так что причин для паники по поводу нового коронавируса пока нет никаких.

4 февраля

Число инфицированных — 20 685 человек, из них умерших — 427, выздоровевших — 726. В Ухане открыли новую больницу на 1000 мест (видео 1). Почти полторы тысячи медработников уже приступили к своим обязанностям.

Такие объявления расклеивают в Великобритании

Рисунок 2. Такие объявления расклеивают в Великобритании. Это — из города Харрогейт (Северный Йоркшир).

Видео 1. Как строилась больница в Ухане

Распространение SARS-CoV-2 на 03 февраля 2020 года

Рисунок 3. Распространение SARS-CoV-2 на 03 февраля 2020 года

6 февраля

Всего 31 485 человек (31 173 в материковом Китае) — инфицированы, 1605 — выздоровели, 638 — умерли.

  • Подтвержден новый путь передачи вируса: фекально-оральный. Так что следите за руками! Тщательно мойте и не трогайте немытыми руками рот, нос и глаза — именно через них вирус проникает в организм. (Вообще, конечно, эти рекомендации, как говорится, на все времена, ведь существует еще множество вирусов, которые передаются таким же способом.)
  • Некоторый шум в прессе поднял препринт индийской статьи о том, что в РНК вируса 2019-nCoV обнаружены вставки от ВИЧ. Индийские исследователи назвали такие вставки сверхъестественными, а конспирологи подхватили и выдали гипотезу об искусственном происхождении вируса. К их огорчению, вставки в геноме 2019-nCoV настолько малы (а две из них вообще с разрывом последовательности), что являются не более чем случайным совпадением. Препринт статьи уже отозвали с сайта.

9 февраля

Число заболевших выросло до 37 583 человек. Умерло — 814, выздоровело — 2860.

  • Национальная комиссия по здравоохранению Китая дала название заболеванию, вызванному вирусом 2019-nCoV. Теперь в китайской прессе его будут называть NCP (novel coronavirus pneumonia).
  • ВОЗ начала плотно работать с ложной информацией о коронавирусной инфекции. ВОЗ не только продолжит на своих платформах правдиво освещать ситуацию, но и заручилась помощью крупных медийных компаний, таких как Facebook, Google, Baidu, Twitter, Pinterest и др. Они будут отфильтровывать дезинформацию в соответствии с данными ВОЗ, CDC и т.д. Это касается, например, советов по лечению инфекции (употребление чеснока, антибиотиков, препаратов от гриппа и пр.), откровенно расистских утверждений (о том, что китайцы из-за своих расовых особенностей наиболее подвержены инфекции) или различных теорий заговора (о лабораторном происхождении вируса).
  • На днях Джеки Чан предложил $197 000 в качестве вознаграждения за разработку лекарства от NCP.
  • А тем временем уханьский Институт вирусологии подал патентную заявку на препарат ремдезивир, разработанный еще в 2016 году американской компанией Gilead Sciences как лекарство от вируса Эбола. В своей работе, опубликованной в Cell Research, китайские ученые утверждают, что комбинация ремдезивира и хлорохина — лекарства от малярии — эффективно ингибирует размножение NCP in vitro в культуре клеток [2]. Ремдезивир — аналог аденозина, который не распознается вирусной РНК-полимеразой, отчего синтез вирусной РНК либо прерывается, либо проходит с ошибками. Препарат считают эффективным против вирусов MERS и SARS, и нескольких других [3].

11 февраля

Инфицированы 45 195 человек. Из них 1116 умерли и 4975 излечились.

  • ВОЗ не удовлетворилась китайским названием болезни и официально приняла своё: COVID-19. Теперь уже, видимо, окончательное.
  • Калифорнийский университет в Санта-Круз (UCSC) опубликовал в интернете геном вируса 2019-nCoV.
  • В Китае начали тестирование на животных вакцины против 2019-nCoV, разработанной Университетом Тунцзи и компанией Stermirna Therapeutics. Вакцина, как сообщают разработчики, содержит часть РНК вируса, с которой синтезируется вирусный белок, и уже на него в организме должны вырабатываться антитела. Сейчас проходят испытания на грызунах. Если они окажутся успешными, то начнутся тесты на обезьянах. А уже потом, в случае положительных результатов, исследования перейдут в фазу клинических испытаний (см. наш спецпроект «Клинические исследования»). В любом случае, по мнению генерального директора ВОЗ, окончательно вакцина может поступить на вооружение клиник не ранее чем через 18 месяцев.

14 февраля

Заболевших уже 64 444 человека. Выздоровевших — 7007 чел., умерших — 1384 чел.

Распространение SARS-CoV-2 на 13 февраля 2020 года

Рисунок 4. Распространение SARS-CoV-2 на 13 февраля 2020 года

  • С 4 февраля количество стран, в которых обнаружена инфекция, не увеличилось (всего 24 страны). Похоже, болезнь удалось локализовать.
  • Китайские ученые предлагают больным переливать плазму крови переболевших, очищенную от вируса. Врачи уже провели более десяти переливаний плазмы производства компании Sinopharm China Bio. Через 12–24 часа лечения основные воспалительные показатели пациентов значительно уменьшились, доля лимфоцитов увеличилась, повысилось насыщение крови кислородом, снизилась вирусная нагрузка, а клинические признаки и симптомы значительно улучшились. Такой метод уже использовали при вспышке атипичной пневмонии.
  • А британская компания The Native Antigen предложила для разработки вакцины использовать два антигена вируса: белки S1 и S2, входящие в состав «шипов» оболочки (подробности смотрите в статье «2019-nCoV: очередной коронованный убийца?» [4]).

19 февраля

Инфицирован 75 201 человек, умерли 2012 человек, излечились 14 905 чел.

  • Китайский CDC опубликовал масштабное исследование всех случаев заболевания до 11 февраля (72 314 пациентов, из которых у 44 672 обнаружен вирус SARS-CoV-2 [бывший 2019-nCoV]). По данным работы, общая смертность держится на уровне 2,3%. Самая высокая — в группе людей старше 80 лет: 14,8%. В группе от 70 до 80 лет8%. Ни одного ребенка в возрасте 0–9 лет не умерло. В группе 10–40 лет смертность равна 0,2%. Мужчин умерло больше, чем женщин: 2,8% и 1,7% соответственно. Сопутствующие заболевания повышают вероятность неблагоприятного исхода: среди людей с сердечно-сосудистыми заболеваниями умерли 10,5%. Также высокая смертность (6–7%) наблюдается среди людей с гипертонией, диабетом и хроническими заболеваниями дыхательной системы.
  • В Китае одобрили к использованию при лечении COVID-19 препарат фавипиравир, изначально разработанный как лекарство против гриппа, блокирующее вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу.
  • Немецкие ученые недавно завершили исследование выживаемости коронавирусов в различных условиях и выявили, что на неживых объектах вирусные частицы могут оставаться активными вплоть до 9 дней [5]. При этом их можно эффективно уничтожить 0,1%-ным гипохлоритом натрия или 62–71%-ным этанолом, обрабатывая в течение 1 минуты.

25 февраля

Заболевших зарегистрировано 80 289 человек. Из них выздоровели 27 789 чел., умерли 2704 чел.

  • Во Франции смогли сдержать распространение болезни. Министр здравоохранения сообщил, что все заболевшие вылечены и новых случаев не зарегистрировано.
  • Европейский Союз продолжает отправлять в Китай средства защиты медработников. Маски, перчатки, комбинезоны и дезинфицирующие средства предоставляют Франция, Германия, Австрия, Италия, Латвия и Эстония. Уже доставлено в Китай 30,5 тонн груза.
  • Греческие ученые установили, что геном вируса SARS-CoV-2 не мозаичный и на 96,3% сходен с вирусом летучих мышей RaTG13 [6]. За счет каких мутаций он приобрел способность заражать человека, пока не ясно, но вероятность, что SARS-CoV-2 пришел именно от летучих мышей, весьма высока.
  • В Калифорнии на макаках резусах исследовали противовирусное действие ремдезивира [7]. Правда, против MERS-CoV, а не SARS-CoV-2. Если препарат начинали давать за 24 часа до инфицирования, симптомов не проявлялось, репликация вируса полностью подавлялась и поражения легких не происходило. Если препарат вводили макакам через 12 часов после заражения, симптомы проявлялись менее выраженно, чем в контрольной группе, репликация вируса понижалась и болезнь сопровождалась менее тяжелым поражением легких или вообще обходилась без него. Ученые считают, что при COVID-19 терапия даст похожие результаты.

1 марта

Всего заболевших с декабря 87 470 человек, умерших — 2990, выздоровевших — 42 670. Суммарно заражение коронавирусом подтверждено в 59 странах (рис. 5).

Распространение SARS-CoV-2 на 1 марта 2020 года

Рисунок 5. Распространение SARS-CoV-2 на 1 марта 2020 года

  • За прошедшие дни, как сообщает ВОЗ, число новых случаев заражения коронавирусом за пределами Китая впервые превысило число случаев заболевания в самом Китае [1].
  • Особое внимание, помимо КНР, приковано к Южной Корее (3736 случаев), Италии (1128) и Ирану (978 случаев, включая и вице-президента по делам женщин и семьи, и замминистра здравоохранения и медицинского образования страны), где количество зараженных увеличивается быстрее всего.
  • Распространению вируса в городе Тэгу Южная Корея во многом обязана христианской секте «Синчхончжи» (Shincheonji, полное название — «Новые небо и Земля»), характеризующейся среди прочего отрицанием болезней и тесным физическим контактом адептов при встречах. Отделения секты находились и в Ухане. 61-летняя последовательница «Синчхончжи», которая никогда не была в Китае, дважды отказалась от проверки на инфекцию, несмотря на наличие симптомов, и посетила собрания религиозной организации, где «успешно» смогла распространить вирус. На встречах присутствовали больше тысячи человек. Женщина позже была диагностирована как 31-й пациент с коронавирусом в Корее, сейчас же, «с ее легкой руки», число зараженных в стране приближается к четырем тысячам. Сегодня стало известно, что глава культа, который по совместительству считается членами «Синчхончжи» мессией, находится под расследованием по обвинению в убийстве.
  • Ирадж Харирчи, замминистра здравоохранения в Иране, сделал заявление перед камерами, что статистика по заражению в Иране ни в коем случае не занижена (поступали заявления об обратном), при этом постоянно утираясь платком. Через день стало известно, что у него также было диагностировано заражение, а Иран сегодня — одна из стран с наиболее быстро растущими цифрами заболевших и очень высокой смертностью.
  • Во Франции людей призывают перестать здороваться поцелуем в щеку (La Bise). США, Тайланд и Австралия сообщают о первых смертях от вируса.
  • Все еще нет ясности в дискуссии о животном источнике заражения. Некоторые эксперты склоняются к версии о панголинах [8], но окончательного подтверждения этой теории пока нет.
  • Заражение SARS-CoV-2 оказало сильнейшее влияние на научное сообщество: скорости получения и обмена информацией резко возросли, как и количество сотрудничеств между лабораториями [9].

15 марта

162 687 случаев заболевания зафиксировано, 6065 смертельных исходов, 75 620 выздоровело. В России официально 63 заболевших, из которых 8 выздоровели. Со времени нашего последнего апдейта:

  • ВОЗ объявила вспышку коронавируса SARS-CoV-2 пандемией (видео).
  • Центр эпидемии переместился в Европу. Вспышка коронавируса поразила Италию (более 21 тысячи случаев), Испанию (приближается к 8 тысячам), Германию (около 5,5 тысяч случаев) и Францию (более 4,5 тысяч случаев). Темпы эпидемии нарастают и в странах с куда меньшим населением, например, в Швейцарии. По этой причине, даже если в абсолютных цифрах они не оказываются в «десятке», то по количеству заболевших на единицу населению ситуация в них очень тревожная.
  • Государства не только запрещают въезд на свою территорию из стран с большим количеством заболевших, но и вовсе закрывают границы и вводят тотальный карантин. Правительства выбирают разные стратегии борьбы с вирусом: от жестких изоляционных до более мягких (например, в Великобритании). Какие окажутся более успешными, покажет время.
  • Ответы на самые популярные вопросы по коронавирусу можно посмотреть в статье How long can the coronavirus live on surfaces, can I get COVID-19 twice, and every other question you might have about the pandemic, а также в нашем материале «COVID-19: отвечаем на вопросы» [10].

За последнее время в российском интернете распространились многочисленные фейки о коронавирусе. Например:

  • Лжеученая Ирина Ермакова выдвинула версию, что коронавирус скрестился с Синтией (искусственной бактерией, созданной Крейгом Вентером в 2010 году на базе Mycoplasma mycoides [11]), которая потом проникла в рыбу, которую продавали в Ухане, разнося тем самым инфекцию! Одно то, что коронавирус (способный заражать только млекопитающих) смог проникнуть в бактериальную клетку, вызывает смех, не говоря уже о других нюансах версии Ермаковой.
  • Сайт фейковых новостей «Панорама» (который этого факта ничуть не скрывает) выдумал новость, что китайские ученые, сделав спектрограмму (!) РНК вируса, увидели там буквы RVNLB — подпись некой секретной американской лаборатории Ravenlab — расположенный в таком месте вирусного генома, которое не поддается секвенированию. Этим они якобы доказали, что коронавирус создали и выпустили на волю американцы. Как мы уже писали в статье «2019-nCoV: очередной коронованный убийца?» [4], геном SARS-CoV-2 полностью секвенировали еще в феврале, выложив сиквенс в интернет в свободный доступ, и никаких странных «некомплектных» букв там не обнаружили (как и неподдающихся секвенированию участков).

Обе эти новости растиражировали СМИ, на телевидении вышли передачи, где всерьёз говорили об этих случаях, в том числе и приглашенные «ученые». «Биомолекула» призывает не поддаваться на провокации и следить за новостями только в проверенных русскоязычных и иностранных изданиях!

21 марта

Заболевших в мире 278 136 человек, 89 259 — выздоровели, 11 570 — скончались. В России подтвержденных случаев заболевания 253, 12 выздоровевших, 1 человек умер.

Распространение SARS-CoV-2 на 19 марта 2020 года

Рисунок 6. Распространение SARS-CoV-2 на 19 марта 2020 года

  • В Ухане с 19 марта не зарегистрировано ни одного нового случая заболевания.
  • На втором месте после Китая по количеству заболевших стоит Италия: 47 021 человек. Из них 4032 уже погибли. Сейчас Италия полностью закрыта на карантин. Очень большое количество активных пожилых людей в стране заставляет медиков строить неблагоприятные прогнозы.
  • Так же большое число инфицированных в Испании и Германии: 25 374 и 21 652 человека соответственно. Испания с 14 марта частично изолирована. Более 1000 военнослужащих введены в 14 городов для обеспечения безопасности. Гражданам разрешается выходить из дома только на работу, покупать еду, посещать аптеку или больницу. В Германии, несмотря на высокое число инфицированных, умерли всего 73 человека.
  • Испания и Германия за последние сутки уже обогнали Иран, где 20 610 заболевших, среди которых 30 членов парламента и чиновников. Поначалу в Иране не могли наладить тестирование на коронавирус из-за санкций на импорт лекарств. На помощь им пришел Китай, отправив тест-системы, одежду и маски. Сейчас уже и ВОЗ посылает в Иран наборы для тестирования. Слухи о том, что контрабандный алкоголь мог бы предотвратить коронавирус, привели уже к 44 смертельным случаям в Исламской Республике. В целях борьбы с эпидемией правительство Ирана в начале марта освободило более 120 000 заключенных, осужденных не по насильственным статьям и на срок менее пяти лет.
  • 20 марта премьер-министр Великобритании Борис Джонсон объявил, что закрываются кафе, пабы и бары, а также магазины, театры и развлекательные центры, чтобы защитить здоровье населения. Правительство откладывает налоги до конца финансового года, а также отказывается от НДС для некоторых предприятий. Это также обеспечит сохранение рабочих мест с выплатой 80% заработной платы тем, кто не может работать из-за пандемии.
  • Международная группа ученых, сравнив геном SARS-CoV-2 с геномами других коронавирусов, установила, что новый вирус имеет естественное происхождение [12].
  • В журнале Cell Discovery 18 марта вышла статья китайских ученых, где они показали противовирусное действие гидроксихлорохина [13] — производного хлорохина, которое, по результатам исследований, проявляет меньшую токсичность для животных, чем хлорохин [14]. А как мы писали выше (9 февраля), хлорохин в сочетании с ремдезивиром ингибирует размножение вируса в культурах клеток [2]. 19 марта Дональд Трамп заявил об очень обнадеживающих результатах хлорохина и гидроксихлорохина против коронавируса. Но Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) сразу же уточнило, что эти препараты еще не одобрены как лекарства от COVID-19. Оба препарата применяют для лечения малярии, волчанки и ревматоидного артрита, и они должны пройти клинические испытания, прежде чем их объявят безопасными и эффективными средствами лечения COVID-19.
  • 17 марта появилась статья американских исследователей, где они изучали стабильность SARS-CoV-2 на различных поверхностях и в аэрозолях [15]. Они обнаружили, что жизнеспособный вирус может быть обнаружен в аэрозолях до 3 часов после распыления, на меди до 4 часов, на картоне до 24 часов и на полипропилене и нержавеющей стали до 2–3 дней. Средний период полужизни SARS-CoV-2 оказался около 2,7 часов. Конкретно для стали он составил около 13 часов и для полипропилена около 16 часов.
  • 17 марта в США стартовало клиническое исследование РНК-вакцины от SARS-CoV-2. Вакцину разработала компания Moderna, а проводить КИ будет Научно-исследовательский институт здоровья вашингтонского отделения организации Kaiser Permanente (Kaiser Permanente Washington Health Research Institute, KPWHRI). Вакцина представляет собой мРНК (mRNA-1273) белка Spike вируса SARS-CoV-2 (о белке Spike читайте в статье «2019-nCoV: очередной коронованный убийца?» [4]).
  • На всей территории России 19 марта введен режим повышенной готовности. С 23 марта школы и вузы будут переведены на дистанционный режим обучения, отменены все массовые мероприятия. Также из-за коронавирусной пандемии пришлось отменить учения по изоляции Рунета, которые планировали провести 20 марта.
  • В большинстве аптек российских городов кончились маски и дезинфицирующие средства. На все вопросы отвечают: «Нет и не будет».
  • На волне паники в Москве (и некоторых других городах) люди стали массово скупать гречку, соль, сахар и туалетную бумагу. Во многих магазинах прилавки опустели на несколько суток.
  • Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» сообщил о начале доклинических испытаний шести (!) собственных вакцин от COVID-19. Как говорится в сообщении, «исследователям удалось создать вакцины как на основе широко применяемых рекомбинантных вирусных векторов гриппа, кори и везикулярного стоматита, так и на основе многообещающих технологий синтетических вакцин: мРНК-вакцины, пептидные вакцины и субъединичные вакцины».
  • Вместе с тем 17 марта в соцсетях начали распространять информацию о вспышке заболевания в поселке Кольцово (где и находится «Вектор»): якобы инфицированы студенты университета и дети из нескольких школ. Министерство здравоохранения Новосибирской области опровергло эти сообщения.
  • Глава Карелии Артур Парфенчиков рассказал о случаях мошенничества в республике, связанных с пандемией. Якобы по квартирам ходят люди, представляясь сотрудниками администрации, и предлагают провести платную дезинфекцию от коронавируса. Также в Карелии уже возбудили дело по поводу продажи «лекарства от коронавируса».
  • Полиция Амурской области, в свою очередь, привлекла к суду женщину, распространявшую в соцсетях ложную информацию о количестве заболевших в области. За такое нарушение предусмотрен штраф от тридцати до ста тысяч рублей.

Не поддавайтесь панике и читайте нашу статью «COVID-19: отвечаем на вопросы» [10]!

1 апреля

Заболевших в мире 887 067 человек, 185 541 — выздоровели, 44 264 — скончались. В России подтвержденных случаев заболевания 2777, 190 выздоровевших, 24 человека умерли.

  • США вышли на первое место по заболеваемости: 190 740 человек инфицировано, 4127 скончался. Вторая по-прежнему Италия: 105 792 и 13 155 человек соответственно. Из этих данных вытекает, что в США летальность (отношение умерших к подтверждённо заболевшим) 2%, а в Италии — более 12%! При этом в Китае, эпицентре заболевания, летальность — 4%. Многие задаются вопросом: «Почему так?» Версий множество. Первая — искаженная статистика: в Италии тестируют (то есть официально подтверждают инфекцию) только тех, кто попал в больницу, поэтому из статистики выпадают все, кто переносит болезнь в легкой форме. Плюс к этому в Италии изначально тестировали всех умерших от всех причин. У многих из них тоже выявили SARS-CoV-2, что, разумеется, тоже попало в статистику. Вторая — в Италии очень много долгожителей, а они наиболее склонны к тяжелой форме инфекции. При сопутствующих заболеваниях, повышающих риски, вероятность их смерти очень высока. Поэтому 87% умерших в Италии — это люди старше 70 лет [16]. Третья — в Италии (правда, по данным за 2011 год) 79% молодых людей живут с родителями, бабушками и дедушками (в Германии, например, всего 23%). А молодежь как раз и есть активные распространители инфекции, причем в большинстве случаев сами переносящие инфекцию в легкой форме или бессимптомно. Четвертая — выживаемость при тяжелой форме зависит от эффективности и быстроты оказания соответствующей помощи. В Италии на момент начала эпидемии количество мест в отделениях интенсивной терапии было всего 5000. Для сравнения — в той же Германии их 28 000! Сочетание всех этих причин и может давать такую статистику по стране.
  • Во многих регионах России к 1 апреля объявлен режим самоизоляции. Жителям рекомендуется не выходить из домов/квартир без необходимости. Административных мер за нарушение режима самоизоляции пока не предусмотрено (в отличие от нарушения режима карантина, который пока относится лишь к тем, кто находится в больницах), кроме статьи 19.4 КоАП: «неповиновение законному распоряжению или требованию должностного лица органа, осуществляющего государственный надзор (контроль),.. влечет предупреждение или наложение административного штрафа на граждан в размере от 500 до одной тысячи рублей». В то же время замглавы комитета Госдумы по госстроительству и законодательству Рафаэль Марданшин заявил, что нарушение режима самоизоляции подпадает под правонарушения, посягающие на общественный порядок и общественную безопасность во время режима повышенной готовности (это не чрезвычайная ситуация). Поэтому в КоАП внесли поправки, которые уже приняла Дума и которые осталось подписать только президенту: статья 20.6 КоАП («влечет предупреждение или наложение административного штрафа на граждан в размере от одной тысячи до тридцати тысяч рублей») и статья 6.3 КоАП («действия (бездействие), совершенные в период режима чрезвычайной ситуации или при возникновении угрозы распространения заболевания... влекут наложение административного штрафа на граждан в размере от пятнадцати тысяч до сорока тысяч рублей»). Такое разнообразие статей дает возможность представителям власти трактовать поведение жителей как угодно и назначать штрафы в зависимости от своего настроения. Передвижение на дальние дистанции в Москве собираются регулировать с помощью выдачи QR-кода. Как в других регионах — не известно.
  • 27 марта Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) выдало разрешение компании Abbott на использование быстрых тестов на коронавирус. Платформа ID NOW COVID-19 обещает выдавать положительный результат в течение 5 минут, отрицательный — 13 минут. Принцип действия основан на изотермической амплификации (правда, нам не удалось найти, какой — RPA или LAMP). Об альтернативах методу ПЦР, таких как RPA и LAMP (или основанных на CRISPR-Cas-системах [17]), читайте в статье «12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция» [18].
  • 28 марта FDA выдало разрешение на чрезвычайное использование противомалярийных препаратов гидроксихлорохинсульфата и хлорохинфосфата для лечения COVID-19. В России тоже собираются применять аналогичный препарат — мефлохин.
  • 28 марта на сайте medRxiv американские ученые опубликовали препринт, рассказывающий о том, что вакцинация против туберкулеза (БЦЖ) снижает заболеваемость и смертность от COVID-19 [19]. Известно, что страны Европы (например, Италия, Нидерланды) и США не прививают планово своих жителей от туберкулеза. Этим авторы статьи объясняют более серьезную эпидемическую ситуацию в этих странах. (О туберкулезе читайте статью на «Биомолекуле» «Болезнь, не думавшая сдаваться» [20].) В Австралии Детский научно-исследовательский институт Мердока собирается провести рандомизированное многоцентровое клиническое исследование для проверки использования противотуберкулезной вакцины БЦЖ против COVID-19.
  • Британский портал Verdict проанализировал сложившуюся ситуацию в мире и спрогнозировал ряд изменений в жизни человечества в ближайшее время.
    • Кризис показал руководителям предприятий, что множество работников могут трудиться удаленно и что можно сэкономить на размере офиса и других ежедневных расходах на каждого сотрудника. В то же время сами работники поняли, что можно экономить на поездках в офис и обедах в кафе. Ситуация также способствует развитию высокоскоростного интернета и различных стартапов по доставке еды и других товаров на дом.
    • Китай, вероятно, запретит рынки, подобные Уханьскому, где продают живых животных, которых забивают при покупателе, чтобы тот нёс домой свежее мясо. Такие рынки всегда были главными распространителями инфекций.
    • Правительства стран могут усилить наблюдение за своими гражданами, в том числе посредством слежки за смартфонами и сбора данных о действиях их владельцев. Толчок к таким мерам дал положительный опыт Китая и Израиля во время пандемии.
    • Возможно, повысится общемировой уровень гигиены (и доходы компаний, производящих средства для дезинфекции и мытья рук). На самом деле, это очень хорошо, поскольку через грязные руки, овощи, фрукты и другую еду передается множество заболеваний (например, разнообразные кишечные), а не только COVID-19.
    • Рост безработицы может привести к введению многими странами универсального базового дохода, чтобы потерявшие работу люди смогли выжить.

24 апреля

По данным Университета Джонса Хопкинса, общее число подтвержденных случаев заражения в мире превысило 2,7 млн, из которых более 190 тысяч закончились летальным исходом, 745 тысяч — выздоровлением. Количество новых случаев заражения снижается во всем мире, но в некоторых странах эпидемия только набирает обороты (рис. 7). Среди них — Россия (68 622 подтвержденных инфицированных, 615 умерших с диагнозом COVID-19), Турция (101 790 и 2491 чел. соответственно) и Бразилия (50 036 и 3331 чел.). Нью-Йорк стал новым эпицентром коронавирусной эпидемии — 263 460 заболевших, из которых умерли почти 21 тыс. человек. Помимо США, от коронавируса больше всего пострадали Испания, Италия, Франция, Германия и Великобритания. В статье Coronavirus tracked: the latest figures as the pandemic spreads вы найдете еще много интересных графиков.

Количество ежедневных смертей с диагнозом COVID-19

Рисунок 7. Количество ежедневных смертей с диагнозом COVID-19 в странах мира

Как государства «закрывались» в течение пандемии

Рисунок 8. Как государства «закрывались» в течение пандемии. Цветовая шкала показывает количество выявленных ежедневных случаев инфицирования.

  • По словам Ханса Клюге (Hans Kluge), представителя ВОЗ, на дома престарелых приходится до половины смертей в Европе. С одной стороны, именно там находятся люди в самой высокой группе риска, но с другой, такая статистика также показывает и то, что дома престарелых не в состоянии обеспечить надлежащие во времена эпидемии уровни защиты и ухода.
  • Продолжается расчет влияния COVID-19 на экономику. Одно из главных мировых агенств, Fitch Ratings, считает, что мировой ВВП может сократиться до 3,9% в 2020 году. При этом бизнесы разных отраслей страдают неравномерно.
    Для поддержания малых бизнесов в некоторых странах уже ослабляют режим общего карантина, например, в Австрии. Немецким магазинам площадью меньше 800 м2 разрешено открыться с понедельника, а Чехия уже частично открыла границы.
  • Журнал PNAS опубликовал любопытную статью о филогении штаммов SARS-CoV-2, собранных у инфицированных по всему миру [21]. Оказалось, что по планете циркулируют три основных типа вируса: A, B и C. За основу взяли коронавирус летучей мыши, с которым у SARS-CoV-2 96,2% сходства. Произошедший от него тип обозначили как A. Что интересно, именно этот, первичный, тип не сильно распространился по Китаю, а по большей части «уехал» в США и Австралию. Зато образовавшийся из A тип B (путем двух мутаций) вполне можно считать «азиатским»: им заражались в основном в Китае и других азиатских странах. Тип C, произошедший от B вследствие одной мутации, представляет собой «европейский» тип вируса: им болеют преимущественно во Франции, Англии, Италии и Швейцарии, однако он также встречается и в Сингапуре, Южной Корее, Бразилии и Гонконге. Анализ филогении позволил понять пути распространения вируса между странами. Например, в Бразилию вирус завезли из Италии 25 февраля. Так же, из Италии, он попал и в Мексику. А дело было так: 28 февраля мексиканец вернулся домой из Италии инфицированным. Его штамм (типа B) оказался «потомком» первого немецкого штамма, выявленного 27 января в Мюнхене у сотрудника компании Webasto, который заразился в Шанхае от китайского коллеги, инфицированного во время поездки к родителям в Ухань!
  • CDC озвучили еще один фактор риска протекания COVID-19 в тяжелой форме — ожирение, при котором индекс массы тела равен или больше 40.
  • На портале Open Longevity вышел очень интересный разбор функций всех белков вируса SARS-CoV-2: «Плохие новости в протеиновой обертке: в геноме у коронавируса».
  • Если хотите в подробностях узнать, как действует коронавирус, попав в организм человека, прочтите статью в Science или посмотрите великолепную инфографику, переведенную на русский язык: «COVID-19. Что он делает с организмом». Если кратко:
    • Когда вирус попадает в организм через нос, рот или глаза, он движется в слизистую носа, где и поражает первые клетки. Там он может размножаться около недели, причем у человека может как не проявляться никаких симптомов, так и повыситься температура, начаться сухой кашель, исчезнуть обоняние и вкус и появиться головная боль.
    • Если за это время иммунная система не справляется с вирусом, он может двинуться вниз по дыхательной системе прямиком в легкие, что уже становится смертельно опасным.
  • На иммунную систему вирус действует следующим образом (по аналогии с действием его ближайшего родственника SARS-CoV). Вирусный белок ORF9b на начальном этапе заражения блокирует выработку интерферона, который должен активировать иммунную систему [25]. В конце концов иммунитет активируется другими путями, и тут вирус перестает блокировать выработку интерферона, в результате чего возникает гиперактивация иммунитета (рис. 9). Запускается «цитокиновый шторм» и клетки иммунной системы начинают усиленно уничтожать зараженные клетки альвеол, из-за чего те быстро наполняются жидкостью. Это и приводит к тяжелым последствиям.
  • Влияние выработки интерферона на течение COVID-19

    Рисунок 9. Влияние выработки интерферона на течение COVID-19. Вверху — нормальное течение болезни. Посередине — вирус сдвигает выработку интерферона, иммунная система гиперактивируется, болезнь протекает тяжело. Внизу — теоретически при постоянно пониженной выработке интерферона болезнь должна протекать по нормальной схеме.

  • Все еще нет окончательного ответа, облегчает ли вакцинация БЦЖ течение COVID-19. В странах, где такой обязательной общей программы вакцинации нет, — США и Италия — эпидемия проходит тяжело (рис. 10). Совпадение это или нет, покажут будущие исследования. В России БЦЖ ставят всем (рис. 11).
  • Динамика COVID-19 по группам стран на стадии «взрыва» пандемии

    Рисунок 10. Динамика COVID-19 по группам стран на стадии «взрыва» пандемии. На графиках показано количество человек на 1 млн населения.

  • На портале PCR.news вышла вторая статья-расследование о тестах на коронавирус, используемых в России: «Тест на коронавирус для России — 2».
  • Более полутора сотен лекарственных препаратов от COVID-19 сейчас находится в разработке. Читайте также нашу статью на эту тему: «Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты» [22].
  • Национальные институты здравоохранения США (NIH) опубликовали резолюцию о лекарственных препаратах против SARS-CoV-2. Краткие тезисы:
    • Недостаточно клинических данных, чтобы рекомендовать использование хлорохина, гидроксихлорохина или ремдесивира для лечения COVID-19, а также реконвалесцентной плазмы и ингибиторов интерлейкинов 6 и 1.
    • Рекомендуется не использовать для лечения COVID-19 комплекс гидроксихлорохин/азитромицин (из-за потенциальной токсичности), комплекс лопинавир/ритонавир или другие ингибиторы протеазы ВИЧ (из-за неблагоприятной фармакодинамики и отрицательных данных клинических испытаний), интерфероны (из-за недостаточной эффективности и токсичности) и ингибиторы Янус-киназы (из-за их широкого иммуносупрессивного эффекта).
  • Продолжается и гонка по разработке вакцин. Среди них — РНК-вакцина Имперского колледжа Лондона, который только что получил от правительства 22,5 млн фунтов стерлингов на проведение II фазы клинических испытаний. Только что стартовали исследования на добровольцах векторной вакцины ChAdOx1 Оксфордского университета, работу над которой начали еще в первой половине января (ее разработка поддержана 20 млн фунтами стерлингов). мРНК-вакцина BNT162 от BioNTech и Pfizer также получила одобрение на проведение I и II фаз клинических испытаний. О создании субъединичной вакцины, которую собираются проверить в доклинических исследованиях на животных моделях, объявил и Массачусетский технологический институт. 20 апреля суммарно пять вакцин находились на стадиях клинических испытаний и еще 71 — на стадии доклиники. О вакцинах от коронавируса у нас тоже недавно вышла статья: «Вакцины против коронавируса: перспективы» [23].
  • В четверг, выступая в Белом доме перед комиссией по коронавирусу, Дональд Трамп высказал две радикальные идеи лечения этой инфекции: облучать человека изнутри сильным ультрафиолетом и вводить внутрь дезинфицирующие средства. Ведь и то, и другое убивает вирусные частицы за считанные минуты! Ни в коем случае не стоит слушать Трампа: употребляйте дезинфицирующие средства только по назначению, а сильного ультрафиолета вообще избегайте — мало того, что он может вызвать ожоги, так еще и способен провоцировать онкологические заболевания.
  • А напоследок посмотрите фотоподборку о том, какие самодельные маски носят люди по всему миру. При этом все-таки надо иметь в виду, что еще в 2015 году международная группа ученых показала, что через тканевые маски проникает более 97% вирусных частиц, а через медицинские маски — 44% [24].

7 мая

Общее число заболевших в мире — 3,8 млн человек. Умерло уже 264 тыс., выздоровело — 1,25 млн. По числу заболевших и умерших по-прежнему лидируют США: 1,2 млн и 73 тыс., соответственно. В России 177 тыс. инфицированных с подтвержденным диагнозом, из которых 1625 человек умерли и 23 800 — выздоровели.

  • Ряд стран (например, Нидерланды, ФРГ, Сербия) постепенно отменяет карантинные меры. Россия тоже ослабляет режим самоизоляции (исключая Москву, где меры продлены до 31 мая), вводя обязательное ношение масок в общественных местах.
  • Карта от Университета Джонса Хопкинса показывает абсолютные значения летальности, и в «пятерку» стран, потерявших от нового коронавируса больше всего человек, входят США, Великобритания, Италия, Испания и Франция.

    Однако судить о размере эпидемии по абсолютной величине количества смертей — не совсем верный подход. В первом приближении, безусловно, стоит пересчитать количество летальных исходов на размер популяции (то есть вычислить смертность). В таком случае «лидировать» будет Бельгия.

    Летальность
    отношение числа умерших от конкретного заболевания к числу больных с этим диагнозом за определенный период времени.
    Смертность
    отношение числа умерших к общему числу населения за определенный период времени.
    Но и на этом не нужно останавливаться: если сравнить смертность прошлого года с нынешней, окажется, что огромное количество «дополнительных» смертей (англ. excess deaths) будет не учтено статистикой по COVID-19. Сложно сказать, смерти ли это от SARS-CoV-2, которые не смогли идентифицировать, или дополнительная смертность, опосредованно вызванная коронавирусом (например, из-за перегрузки системы здравоохранения пациенты с сердечно-сосудистыми заболеваниями не смогли вовремя получить медицинскую помощь) или чем-то еще. Однако оценка этого параметра очень важна, поскольку именно она даст представление о том, насколько каждая страна пострадала в эту пандемию.

    Подробности и графические изображения приведены на видео 2 от Sky News. В частности, в нем сравнивается суммарная смертность в Англии и Уэльсе по домам престарелых в прошлом году и в этом и приводятся числа, насколько сильно «недосчитывает» смертей официальная статистика: например, на конкретный момент времени — достижение 11 тысяч смертельных случаев — в Великобритании «дополнительные смерти» составляли 38%, а в Италии и вовсе 118%.
  • Видео 2. Настолько ли высока летальность от COVID-19 в Великобритании, как кажется?

  • Израильский институт биологических исследований (IIBR) объявил о получении моноклональных антител против нового коронавируса. Подобные антитела создали и в Нидерландах, опубликовав статью в Nature Communications [26]. Антитела специфичны к белку Spike (шипу на оболочке вируса, с помощью которого он и проникает в клетки) и подавляют размножение SARS-CoV-2 в культурах клеток. Уже запланированы испытания на животных и людях.
  • Независимое медиа «Проект» выпускает подкаст «В эпицентре», где сами врачи рассказывают, как они борются с пандемией и не боятся говорить о проблемах на местах и в российской медицине в целом. Первая серия подкаста вышла 2 апреля, пятая — 2 мая. Послушайте эту захватывающую хронику событий из эпицентра.

Литература

  1. Novel Coronavirus (2019-nCoV) situation reports. WHO;
  2. Manli Wang, Ruiyuan Cao, Leike Zhang, Xinglou Yang, Jia Liu, et. al.. (2020). Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro. Cell Res. 30, 269-271;
  3. Michael K. Lo, Robert Jordan, Aaron Arvey, Jawahar Sudhamsu, Punya Shrivastava-Ranjan, et. al.. (2017). GS-5734 and its parent nucleoside analog inhibit Filo-, Pneumo-, and Paramyxoviruses. Sci Rep. 7;
  4. 2019-nCoV: очередной коронованный убийца?;
  5. G. Kampf, D. Todt, S. Pfaender, E. Steinmann. (2020). Persistence of coronaviruses on inanimate surfaces and their inactivation with biocidal agents. Journal of Hospital Infection. 104, 246-251;
  6. D. Paraskevis, E.G. Kostaki, G. Magiorkinis, G. Panayiotakopoulos, G. Sourvinos, S. Tsiodras. (2020). Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-nCoV) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event. Infection, Genetics and Evolution. 79, 104212;
  7. Emmie de Wit, Friederike Feldmann, Jacqueline Cronin, Robert Jordan, Atsushi Okumura, et. al.. (2020). Prophylactic and therapeutic remdesivir (GS-5734) treatment in the rhesus macaque model of MERS-CoV infection. Proc Natl Acad Sci USA. 201922083;
  8. David Cyranoski. (2020). Mystery deepens over animal source of coronavirus. Nature. 579, 18-19;
  9. Kai Kupferschmidt. (2020). ‘A completely new culture of doing research.’ Coronavirus outbreak changes how scientists communicate. Science;
  10. COVID-19: отвечаем на вопросы;
  11. Жизнь в эпоху синтетической жизни;
  12. Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry. (2020). The proximal origin of SARS-CoV-2. Nat Med;
  13. Jia Liu, Ruiyuan Cao, Mingyue Xu, Xi Wang, Huanyu Zhang, et. al.. (2020). Hydroxychloroquine, a less toxic derivative of chloroquine, is effective in inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro. Cell Discov. 6;
  14. Evan W. McChesney. (1983). Animal toxicity and pharmacokinetics of hydroxychloroquine sulfate. The American Journal of Medicine. 75, 11-18;
  15. Neeltje van Doremalen, Trenton Bushmaker, Dylan H. Morris, Myndi G. Holbrook, Amandine Gamble, et. al.. (2020). Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1. N Engl J Med;
  16. Edward Livingston, Karen Bucher. (2020). Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) in Italy. JAMA;
  17. Curti L., Pereyra-Bonnet F., Gimenez C.A. (2020). An ultrasensitive, rapid, and portable coronavirus SARS-CoV-2 sequence detection method based on CRISPR-Cas12. bioRxiv;
  18. 12 методов в картинках: полимеразная цепная реакция;
  19. Miller A., Reandelar M.J., Fasciglione K., Roumenova V., Li Y., Otazu G.H. (2020). Correlation between universal BCG vaccination policy and reduced morbidity and mortality for COVID-19: an epidemiological study. medRxiv;
  20. Болезнь, не думавшая сдаваться;
  21. Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, Michael Forster. (2020). Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes. Proc Natl Acad Sci USA. 202004999;
  22. Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты;
  23. Вакцины против коронавируса: перспективы;
  24. C. R. MacIntyre, H. Seale, T. C. Dung, N. T. Hien, P. T. Nga, et. al.. (2015). A cluster randomised trial of cloth masks compared with medical masks in healthcare workers. BMJ Open. 5, e006577-e006577;
  25. Rudragouda Channappanavar, Anthony R. Fehr, Rahul Vijay, Matthias Mack, Jincun Zhao, et. al.. (2016). Dysregulated Type I Interferon and Inflammatory Monocyte-Macrophage Responses Cause Lethal Pneumonia in SARS-CoV-Infected Mice. Cell Host & Microbe. 19, 181-193;
  26. Chunyan Wang, Wentao Li, Dubravka Drabek, Nisreen M. A. Okba, Rien van Haperen, et. al.. (2020). A human monoclonal antibody blocking SARS-CoV-2 infection. Nat Commun. 11.
https://siriusbiotech.ru//?erid=2VfnxwBZiac

Комментарии