Конкретно ЦГА Москвы хранит документы по городу Москве, Московской области и Московской губернии (с некоторыми особенностями, потому что часть документов по нынешней Московской области находится в Центральном государственном архиве Московской области, часть — в ее районных архивах), т.е. по своему статусу это именно региональный архив. Если вы живёте в Москве, но ваши предки из Кировской области, обращаться надо в архив Кировской области, а не ЦГА Москвы.
В ЦГА Москвы есть несколько отделов:
отдел хранения документов до 1917 года,
отдел хранения документов после 1917 года,
отдел хранения документов общественно-политической истории Москвы,
отдел хранения научно-технической документации Москвы,
отдел хранения документов личных собраний Москвы,
отдел хранения аудиовизуальных документов.
Подробнее о каждом отделе и о хранящихся в них собраниях, читайте по ссылке.
ЦГА СПб хранит фонды местных органов власти советского и постсоветского периодов— Петросовета, губернского, областного, городского, районных (города), уездных и волостных Советов с момента их возникновения до ликвидации, районных администраций. Имеется ряд фондов организаций Временного правительства — управы городской и районных дум, милиции. Подробнее по ссылке.