"Генетическая программа" в зиготе?

 Последовательность нуклеотидов в ДНК определяет то, как клетка многоклеточного организма будет реагировать на физические сигнальные факторы – градиенты механического напряжения, градиенты гравитационных сил, тепла, влажности и т.п. и химические сигнальные факторы – градиенты и концентрации сигнальных веществ (см. морфогены и гомеозисные гены). Т.е. реализация программы онтогенеза – это алгоритм управляемой самоорганизации, появляющийся как эмерджентное свойство совокупности клеток, взаимодействие которых базируется на индивидуальной программе реакции каждой клетки на средовую/позиционную информацию, сообразно которой в клетках перестраивается экспрессия генов посредством эпигенетического регулирования, что ведёт к специализации клеток (или их запрограммированной гибели) и формированию органов и тканей многоклеточного организма.

 Для общего понимания механизма реализации генетической информации сначала удобнее ознакомиться с упрощённой моделью морфогенеза (см. Процессы самоорганизации в онтогенезе многоклеточных: опыт имитационного моделирования). А потом рассмотреть некоторые весьма непростые подробности морфогенеза тех или иных структур организма (см., например, Дай пять: как математика управляет развитием пальцев и Эмбриональные клетки вычисляют свои координаты математически оптимальным способом).